采用基因芯片篩選肝癌轉移相關基因的研究
發布日期：2007-09-20 10:27 文章來源：丁香園
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關鍵詞： cDNA
芯片
肝細胞肝癌
CSCO
腫瘤學大會
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第二軍醫大學東方肝膽外科醫院綜合治療一科
王 葵 沈 鋒 施樂華閻振林衛立信叢文銘 孟超
??? 摘要 目的：用人基因表達譜 cDNA 芯片研究原發性肝癌(HCC)與癌旁正常肝組織的基因表達差異并進行驗證。方法：利用含有人 5075 個基因 cDNA 的人表達譜芯片，將 6 例原發性肝癌患者分為伴和不伴門靜脈癌栓兩組(A 組和 B 組，每組 n=3)，分別取癌組織、癌栓組織和癌旁正常肝組織，分別抽提總 mRNA,反轉錄為 cDNA 與芯片進行雜交，對比 mRNA 表達的差異。在差異表達的基因中，選取 9 個基因在 41 例肝癌病人癌和癌旁正常肝組織進行 RT-PCR 實驗驗證其表達情況。 結果：癌組織及癌栓組織與癌旁正常肝組織比較，伴門脈癌栓組(A 組)癌組織與不伴門脈癌栓組(B 組)癌組織中上調表達基因分別有 169 和 170 個，兩組下調表達基因分別有349 和 364 個，其中兩組共同上調表達基因中 135 個，共同下調表達基因 305 個。兩組癌組織分別表達上調和下調的基因之中，表達明顯上調的基因(ratio>3)無癌栓組有 3 個、癌栓組有 5 個，而明顯下調的(ratio<0.4)無癌栓組有 4 個、癌栓組有 10 個。分別挑選兩組癌組織共同高表達基因(ASPH)、共同低表達基因(MT1X)、有癌栓組高表達基因(FACL4、POSTN、MAP4K4 、HSF1、UCHL1、DAP3、IARS)共 9 個，在 41 例 HCC 病人組織和四種肝癌細胞系中進行 RT-PCR 檢測，其中 ASPH、MT-1X、MAP4K4 、FACL4、DAP3、HSF1 在癌組織中的表達與癌旁組織比較有顯著差異或有差異(P＜0.01 或 P＜0.05)。結論：基因表達譜 cDNA 芯片是檢測肝癌差異基因表達的有效方法，其基因變化可以進一步在 RT-PCR 中證實。ASPH、MAP4K4 、FACL4、DAP3、HSF1 和 MT-1X 在癌組織中表達明顯高于和低于癌旁組織，在肝癌細胞系中表達亦增高和降低，但在 41 例標本中表達變化與伴或不伴門靜脈癌栓相關性不明顯。
??? 關鍵詞 cDNA 芯片；肝細胞肝癌；門靜脈癌栓；基因表達譜
編輯: yang 作者:丁香園通訊員
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