DDW 2018 | 復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染患者糞便菌群移植效率低,是供體的原因嗎?
2018-06-12 21:06 來源:丁香智匯
美國時間 6?? 月 2?? 日上午,在沃爾特華盛頓會議中心舉辦的美國消化疾病周(DDW2018)上,美國胃腸病學(xué)會(AGA)組織了胃腸道微生物群和微生物疾病的杰出摘要全體會議。來自美國波士頓兒童醫(yī)院的 Majdi Osman,在會上分享了他們團(tuán)隊關(guān)于糞便菌群移植(FMT)對復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染(CDI)治療低效是否與供體有關(guān)的最新研究進(jìn)展。

在使用糞便菌群移植(FMT)對復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染(CDI)進(jìn)行治療的過程中,是否存在糞便供體效應(yīng)?
雖然 FMT 對復(fù)發(fā)性 CDI 的治療有效,然而在兩項關(guān)于 FMT 治療潰瘍性結(jié)腸炎的臨床試驗中,發(fā)現(xiàn)了糞便供體效應(yīng),但沒有證據(jù)顯示供體特征決定 CDI 的臨床治愈。糞便庫通過標(biāo)準(zhǔn)的捐贈者選擇和嚴(yán)格的質(zhì)量控制,對大量的捐贈者和站點監(jiān)測,發(fā)現(xiàn)療效上的明顯差異。通過分析患者和捐贈者的微生物群落特征,以評估造成明顯供體效應(yīng)的原因。
排除干擾因素,不同供體之間的糞便菌群移植效率并沒有明顯差異
2014 年 1 月 16 日-2016 年 4 月 12 日期間,研究團(tuán)隊收集了美國 50 個州和其他 8 個國家 945 家醫(yī)療機(jī)構(gòu)的患者信息,包括 CDI 的類型(復(fù)發(fā)性、難治性)、FMT 操作方式、保健師和醫(yī)生記錄的臨床結(jié)果等。患者的數(shù)據(jù)與糞便捐贈者相關(guān)聯(lián)。
通過 16S rRNA 測序確定供者的糞便微生物分布。通過 QIIME 構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)操作分類單元(OUT)和分類表(97% OTU)。用 Phyloseq 法測定了α-多樣性 (Shannon 指數(shù))、β-多樣性 (Jensen-Shannon 多樣性,JSD) 和分類異常相對豐度。對復(fù)發(fā)性 CDI 和與供體療效的相關(guān)的因素進(jìn)行回歸分析。
51 個供體治療了 2050 例復(fù)發(fā)性 CDI 患者。供體平均年齡 28 歲(19-45),40/51(78%)為男性患者,平均體重指數(shù)(BMI)為 22.75 kg/m2。其中一個供體(供體 X)相比其他供體,表現(xiàn)出較低的臨床治愈率 (70.5%, 61/86, P<0.05),其他供體整體平均臨界治愈率(88.4%)。
通過 16s RNA 測序評估了供體 X 和其他 19 個健康供體的微生物菌群,供體 X 和其他捐贈者的α-多樣性沒有差異(圖 1a);

(圖 1a)
與其他隨機(jī)選擇的 4 個供體相比,供體 X 的平均 JSD 最低(圖 1b);

(圖 1b)
開始階段,供體 X 的微生物組成和其他所有供體相似(圖 2)。

(圖 2)
為了評估受體和環(huán)境的因素,通過校正醫(yī)療設(shè)施、操作方式和疾病類型后,回歸分析顯示供體 X 和其他供體的糞便菌群移植效率沒有明顯差異(P = 0.08)。
供體因素并不會影響復(fù)發(fā)性 CDI 患者的臨床治愈率
這是首次在真實患者中進(jìn)行的通過對供體微生物組測序分析糞便菌群移植低效率的回顧性研究。此次研究結(jié)果證實,供體因素不會影響復(fù)發(fā)性 CDI 患者的臨床治愈率。與供體因素相比,受體因素和臨床經(jīng)驗,包括合適的 CDI 病例,可能會影響 FMT 的結(jié)果。