【現場 | 線上】轉錄組學專題實操班（7.21-24）

近年來，隨著高通量測序技術的迅猛發展，轉錄組研究從以前的微陣列技術，SAGE 及 MPSS 技術的低通量模式切換至 RNA-seq 的高通量模式。轉錄組學作為一個伴隨高通量測序技術率先發展起來的技術開始在生物學前沿研究中得到了廣泛的應用。RNA-seq 對于真核生物的基因表達調控，癌癥等疾病的發生機制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉錄組高通量測序技術原理、實驗設計以及后期數據分析技能，舉辦「轉錄組學」專題實操班。歡迎報名參加。更多消息可關注「生信會議」公眾號，會給您帶來更多驚喜！

主辦單位：北京市計算中心
協辦單位：
北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心
云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室
北京市計算中心—工信部和信息化人才培養工程培訓基地
北京市計算中心—北京市大數據教學實踐基地
聽課方式：線上直播、現場聽課，按需選擇。

課程安排：2020 年 7 月 21-24 日 ?? 上午 9：30-11：30?? 下午 13：30-17：00

第一天
轉錄組學前沿概述
1. 轉錄組技術發展前沿動態
2. 轉錄組應用案例及應用熱點
轉錄組學實驗和分析基礎
1. 轉錄組學研究的實驗技術
2. 轉錄組技術流程及技術細節（重點講解）
3. 常用的轉錄組測序建庫技術
Linux 基礎操作

第二天
De novo 轉錄組數據分析上機實踐
1. 原始測序數據的檢測和預處理（重點講解）
2. 使用 Trinity 拼接轉錄組數據（重點講解）
3. 原始數據與拼接轉錄本的比對（重點講解）
4. 表達量統計和差異表達分析（重點講解）
5. 使用 blast 對轉錄本進行功能注釋（重點講解）
6. 尋找轉錄本的 ORF，翻譯蛋白質序列
7. 轉錄因子注釋
Reference based 轉錄組數據分析上機實踐（一）
1. 轉錄組數據準備和軟件介紹
2. 使用 HISAT 進行轉錄組數據的比對（重點講解）
3. 用 IGV 查看比對結果
4. 使用 cufflinks 進行表達量估計和分析（重點講解）
5. 使用 samtools 檢測轉錄組數據中的突變（重點講解）
6. 差異表達基因的功能分析（重點講解）

第三天
Reference based 轉錄組數據分析上機實踐（二）
1.lncRNA 目前的定義、應用和發展
2.lncRNA 的生物學過程（重點講解）
3.lncRNA 的測序（重點講解）
4.lncRNA 測序數據分析案例展示（重點講解）
5. 利用 tophat 和 cufflinks 組合，預測轉錄本
6. 使用 CNCI 預測新的 lncRNA 轉錄本（重點講解）
7. 使用 LncTar 軟件預測 lncRNA 調控的靶基因（重點講解）
microRNA 測序與數據分析（包含上機實踐）
1.microRNA 目前的應用、發展歷史以及 microRNA 的定義
2.microRNA 的生物學過程（重點講解）
3.microRNA 的測序（重點講解）
4.microRNA 測序數據分析軟件（重點講解）
5.microRNA 測序數據預處理（重點講解）
6.microRNA 的預測（重點講解）
7.microRNA 靶標基因預測，結果提取、統計（重點講解）

第四天
10x 單細胞轉錄組測序數據常規分析流程介紹及上機實操
1.10x 單細胞測序技術在科研領域的應用
2.10x 單細胞實驗建庫原理介紹
3.10x 單細胞轉錄組下機數據處理
4.10x 單細胞軟件 Cellranger 講解及實操（重點講解）
5. 從單細胞表達矩陣開始到 marker 基因篩選全過程講解及實操

注：課程以實際發生為準；若調，會提前通知。

【報名費用】
線上直播：4200 元/人
含本次聽課費、上機賬號 1 個、資料費、證書費、考試費 (如有)。
贈送一年內同等金額同課程體系線下班一個和線下 7 折班一個（備注：若您不方便參加線下班可將贈送的線下班換成 2 個線上班。）

現場聽課：3600 元/人
含本次聽課費、上機賬號 1 個、資料費、證書費、考試費 (如有)。

開具增值稅發票，提供蓋章通知、結業證書等相關材料。
課程結束后，可將上課期間用到的數據、PPT 資料、腳本、視頻等相關文檔，通過移動硬盤郵寄的方式快遞到您手上，便于您后續繼續學習使用。

【報名優惠政策】
1、3 人以上團體報名每人可減少 300 元；
2、4+1 團報，可免費贈送一個名額；
3、上面優惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；
老學員參加及推薦學員參加均可額外優惠 200 元。

【包年優惠價】
按年付費，45000 元/人。包括報名后 1 年以內所有線上課程；高性能計算資源基礎賬號 1 個，使用期限 1 年；線下培訓名額 2 個。

【付費方式】
銀行賬號信息：
單位全稱：北京市計算中心
賬號：0200151819100023937
開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行
（匯款信息備注：「生物計算——您的姓名」, 個人匯款請備注單位名稱）
注：款項支出后，請提供付款回執給工作人員，方便核實到賬、開具發票。

【報名回執】
訪問此鏈接填寫報名回執?https://www.wjx.top/jq/80710449.aspx

【咨詢請聯系】
QQ 號：2814500767
郵箱：bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老師 010-59341786，15801436028（微信同號）
員老師 010-59341773，18701529461（微信同號）

【注】開課前三天會發送郵件通知；確認開課后，開課前一天會將直播鏈接及上機賬號發至您郵箱或微信。如未收到，請及時電話咨詢。 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

編輯： 會議君    來源：丁香園