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      用R語言進行科研數(shù)據(jù)挖掘?qū)崙?zhàn)會議(6.6-7 網(wǎng)絡精講班)

      作者:   2020-05-08
      字體大小:
      • 會議時間: 2020-06-06至 2020-06-07
      • 會議地點: 上海
      • 電話:13621834129
      • 傳真:
      • 聯(lián)系人:王老師
      • Email: msh088@126.com
      • 聯(lián)系地址:
      • 會議網(wǎng)址:

      用R語言進行科研數(shù)據(jù)挖掘?qū)崙?zhàn)會議(6.6-7 網(wǎng)絡精講班)

      無實驗無數(shù)據(jù)沒關(guān)系,用R語言挖掘別人的數(shù)據(jù),發(fā)表自己的文章

      兩天一夜高強度實訓,講究實戰(zhàn),所有經(jīng)驗和盤托出

      會后贈講課錄像便于反復復習(加密播放不零售,保障學員優(yōu)勢權(quán)利)

      第十八期 2020/6/6-7? (兩天&一晚,網(wǎng)絡精講班,微信群長期答疑)

      還在認為沒有實驗就不能發(fā)表論文?還在為不精通挖掘GEO,TCGA,SEER的數(shù)據(jù)庫而痛苦不堪?還在為不知道如何找課題找靶點而苦惱?還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神?快來參加莫速乎的科研數(shù)據(jù)挖掘?qū)崙?zhàn)專題學習班吧,挖掘別人的數(shù)據(jù),發(fā)表自己的文章,一次學習,不再報班!

      本會議由于帶著明確的目的性去學習R語言,且針對有/無R語言基礎(chǔ)的學員均具有很大寬容性,自開班起就廣受好評。隨著近年來生物信息學技術(shù)的普及,R語言是每個科研工作者都有必要掌握的技能,以往漫無目的的學習R效果不理想,用R去進行科研數(shù)據(jù)挖掘,既學習了R又解決了實際科研問題。

      學完課程并掌握后能干什么:

      1.沒有課題的時候找到課題,沒有機制的時候挖掘機制

      2.為基金申請保駕護航,發(fā)表paper如虎添翼

      3.掌握R語言的核心技能,GEO,TCGA,SEER的數(shù)據(jù)處理沒有壓力

      4.科研繪圖:以一敵百,高端大氣,私人訂制。

      這是一份帶有誠意且注重實戰(zhàn)的數(shù)據(jù)挖掘課程。我們的目標是:一次學習,不再報班。

      課程特點:

      1.不留秘密,私貨全出,全程只用R語言,關(guān)鍵步驟不隱藏。

      2.第一天晚上時間充分利用,增加帶有講師指導的練習,更多的訓練時間,更好的掌握。

      3.講最核心的知識,講通用的技能,適合各個專業(yè)。學后可應用到其他數(shù)據(jù)庫的挖掘。

      4.實例操作(至少3個套路),讓你快速掌握數(shù)據(jù)挖掘套路。

      5.現(xiàn)場完成一篇paper的思路以及圖表。

      6.講師陣容強大,內(nèi)容豐富深入

      主講人簡介:

      果子老師,在生信方面具有豐富經(jīng)驗,本次進行兩天一晚的高強度實操訓練,目標是讓大家一次學習不再報班。講師已在生信網(wǎng)站及公眾號發(fā)布上萬條生信相關(guān)帖子。作為臨床科研工作者,深知無課題之苦,因此愿將所學知識和盤托出,沒有隱藏。致力于給非生信專業(yè)人員普及生物信息學,擅長各種組學的處理,且講課詼諧幽默。

      適合人群:

      廣大臨床/科研工作者及心有熱血被困囚籠的研究生

      課程安排:

      第一天

      08:30-11:55

      R語言基礎(chǔ)知識介紹

      R語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)以及循環(huán)控制(向量,因子,矩陣,數(shù)據(jù)框,列表,for循環(huán),if控制)

      編寫自己的第一個批量處理數(shù)據(jù)的程序

      R語言中數(shù)據(jù)框的操作(增刪改查)

      真實數(shù)據(jù)的清洗和整理

      R包以及bioconductor資源的使用

      R包無敵安裝攻略

      R語言繪圖系統(tǒng)

      R語言的讀入以及寫出數(shù)據(jù)

      統(tǒng)一午餐

      13:30-17:00

      使用卡片復習R語言基礎(chǔ)知識(2天中重復4次)

      GEO數(shù)據(jù)庫成套流程實戰(zhàn)(數(shù)據(jù)清洗,熱圖,火山圖,GO分析,KEGG分析,共表達分析)

      GEO數(shù)據(jù)便捷實用的GSEA分析

      GEO芯片的探針probe轉(zhuǎn)化方法匯總

      多個GEO芯片聯(lián)合分析

      TCGA數(shù)據(jù)庫背景介紹+閱讀文獻

      TCGA相關(guān)的網(wǎng)頁工具匯總學習

      介紹不同的癌癥和不同組學

      不同的分析套路解讀(WGCNA,signatures,miRNA-mRNA配對或者ceRNA等)

      TCGA數(shù)據(jù)分析的軟硬件準備

      下載及理解TCGA數(shù)據(jù)(所有數(shù)據(jù))

      R制作TCGA表型數(shù)據(jù)臨床三線表

      17:00-18:00

      統(tǒng)一晚餐

      晚上

      18:00-21:00

      R語言數(shù)據(jù)框的操作練習(掌握tidyr和dplyr)

      如何根據(jù)需求繪制一個漂亮的火山圖(學習ggplot2)

      使用R語言制作特定腫瘤所有基因表達的數(shù)據(jù)庫

      TCGA原始數(shù)據(jù)的下載(GDC的方法和R包方法)

      任意癌癥任意基因在癌和癌旁的表達

      如果有亞型,在不同亞型中的表達

      如果有腫瘤有分期,在不同臨床分期中的表達

      單個基因在多個正常組織中的表達

      單個基因在多個細胞系中的表達

      單個基因在多個腫瘤中的表達

      兩個基因的相關(guān)性如何分析

      第二天

      08:30-11:55

      差異分析(從counts數(shù)據(jù)開始整理表達數(shù)據(jù),表達矩陣歸一化,DESeq2)

      提取mRNA矩陣

      提取IncRNA矩陣

      提取MiRNA矩陣

      ceRNA網(wǎng)絡構(gòu)建

      單基因的GSEA分析

      神技能:注釋任何一個基因包括長鏈非編碼RNA

      使用多種統(tǒng)計算法定位 signatures cox,lasso回歸

      生存分析

      繪圖美化

      任意癌癥中任意基因的生存分析

      任意癌癥中批量生存分析

      TCGA文章的框架分析以及復現(xiàn)

      答疑環(huán)節(jié)

      統(tǒng)一午餐

      13:00-16:30

      利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)庫找到課題

      利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)庫發(fā)掘下游機制

      如何利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)庫申請基金

      如何利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)庫發(fā)表文章

      現(xiàn)場完成一篇生信文章的所有圖表

      提出科研假設(shè)

      根據(jù)科研假設(shè)下載整理數(shù)據(jù)導入R語言

      在R語言中清洗和整理數(shù)據(jù)達到對應R包的要求

      數(shù)據(jù)處理過程中調(diào)整分析策略

      繪制各個部分需要的圖標

      時間地點:

      第十八期 2020/6/6-7? 使用騰訊會議客戶端進行在線講課(非錄播)(會議時間兩天&一晚)

      報名付費成功后,提前發(fā)培訓需要應用到的軟件與課件,并且指導安裝

      注冊費用:3400元/人

      兩天集中網(wǎng)絡授課,互動性好;

      可開具會務,數(shù)據(jù)分析等發(fā)票;

      可回放,可免費復聽;

      參加培訓的學員可通過微信群繼續(xù)和老師交流,長期獲得答疑機會;

      如果本次沒學會,以后還可免費參加本班(疫情過后可免費參加線下培訓)。

      主辦單位:上海莫速乎教育投資有限公司、上海荊麥信息科技中心

      報名咨詢:王老師? 136 2183 4129 (微信同號) msh088@126.com

      歡迎來電來郵件或者微信咨詢索取word函件

      編輯: 會議君   

      聲明:

      1.丁香會議頻道僅負責發(fā)布會議信息,如需參會、獲取邀請函或會議日程,請與主辦單位聯(lián)系

      2.部分會議信息來自互聯(lián)網(wǎng),如您發(fā)現(xiàn)信息有誤,請聯(lián)系meeting@dxy.cn糾錯

      3.如您發(fā)現(xiàn)信息不全,可點擊Google搜索更多

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