單細胞測序數據挖掘與課題設計、基金申請實戰會議（6.13-14 網絡精講班）

作者： 2020-05-08

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會議時間： 2020-06-13至 2020-06-14
會議地點：上海
電話：13621834129
傳真：暫無
聯系人：王老師
Email： msh088@126.com
聯系地址：
會議網址：

會議背景：

在最近三五年內如果去介紹一個科研領域內的熱點明星，我會毫不猶豫的推薦單細胞測序。從基金申請熱度上來看，目前單細胞話題已經穩居前二，在測序領域單細胞測序的熱門程度也逐漸超越了傳統的RNAseq和ChIPseq，逐漸成為了新的流量話題王。

2017年10月16日 “人類細胞圖譜計劃”問世。第一批資助項目總計38個，其中唯一來自中國的是清華大學張學工教授，主要任務是“研究單細胞測序分析的生物信息學全景，為項目的后續發展提供基準參考”，在該項目的推動下單細胞測序熱潮更是不斷走高。

從09年的第一篇單細胞測序文章到現在10年的時間，單細胞測序的技術，分析算法，科研以及臨床應用都取得了非常大的進步。積累的寶貴數據更是十分誘人，單單GEO數據庫收錄的單細胞研究樣本已經近2萬例，而且數據的增長呈現明顯的指數上升趨勢，而且單細胞測序幾乎成為非常多CNS優秀文章的標配。但是居高不下的實驗及測序成本一直困擾著大部分科研人員，動輒3萬+/樣，單個課題起碼測個6例以上最低投入也接近20萬，如果再加上實驗失敗的樣本費用及分析費用預計在30萬上下。

那么有沒有較低門檻可以介入單細胞測序領域快速發文章的方法呢？

我們邀請到國內第一批做單細胞測試實驗室的Dr Wang，為大家專門設計了一門數據挖掘課程，專門針對單細胞轉錄組測序數據進行「課題設計以及數據挖掘」。數據挖掘類的文章伴隨二代測序的發展已經有了趨于成熟的研究策略，但是目前進行傳統測序數據挖掘的研究太多，發文的難度也是越來越高。

但是單細胞測序數據的挖掘目前還是處于從零開始的狀態，而這座巨大的數據寶庫又那么誘人。所以我們在努力爭做第一批吃螃蟹的人，從單細胞測序的原理，挖掘思路的尋找，到找數據，到整合分析，再到結果解讀以及成文思路，課程都會進行詳細的講解及演示，并提供一套老師寫好的高度自動化的分析代碼直接產出發表級別的圖。爭取讓學員通過課程能盡可能全面的了解單細胞是什么，能做什么，以及該怎么做。

可能會有學員關心自己關注的課題領域是否有足夠的測序數據可供挖掘，目前在公共數據庫中的單細胞測序幾乎都圍繞常見模式生物來做。人，小鼠，斑馬魚等，涉及正常組織、血液、不同發育階段樣本，疾病類型也各種各樣包括腫瘤、免疫細胞、炎癥類甚至包括較難研究的神經、肌肉、骨骼等。最重要的是，它一直在增加，因此我相信您也一定能參與進來。

課程目標及特色：

1. 編程零基礎學員即可參加，用通俗易懂的方式掌握R語言基本語法及做生信分析的技能；

2. 了解單細胞測序的基本概念、原理、主要數據庫及下載流程方法；

3. 通過全流程講解單細胞測序及分析，掌握單細胞挖掘的全流程，及單細胞轉錄組的發文思路；

4. 通過高度自動化的代碼全分享，學會用R軟件進行單細胞轉錄組分析及作圖

5. 掌握零成本的單細胞相關課題設計思路，基金申請注意事項，可輔導針對性的課題設計及實操；

6. 通過課程學習可直接接近產出文章，課后講師定期答疑；

主講人簡介：

Dr Wang，國內最先做單細胞測序的團隊成員之一，長期致力于研究高通量測序技術及數據分析，研究方向為單細胞測序技術的研發分析及臨床應用，擅長生物信息學的數據挖掘及課題設計，單細胞轉錄組及多組學數據分析與挖掘。累積發表數據挖掘類SCI文章40+篇，其中10分以上達5篇。參與并完成了包括國家自然科學基金、863計劃及國家科技重大專項項目等在內的數10項國家科研項目。

課程安排：

第一天上午

8:30-10：30

生物信息學及單細胞轉錄組介紹

1.生物信息簡介

2.如何學習并入門生物信息

3. 自學生信需要哪些條件

4. 二代測序到底在測什么

5. 二代測序的地位及防騙指南

6. 單細胞轉錄組技術發展歷史

7. 單細胞測序的重要性

8. 當前單細胞測序的進展及投入程度