用 R 語言進行科研數據挖掘實戰會議（7.11-12 網絡精講班）

無實驗無數據沒關系，用 R 語言挖掘別人的數據，發表自己的文章
兩天一夜高強度實訓，講究實戰，所有經驗和盤托出
會后贈講課錄像便于反復復習（加密播放不零售，保障學員優勢權利）
第十九期 2020/7/11-12 ?（兩天 & 一晚）
第二十期 2020/8/15-16 ?（兩天 & 一晚）
網絡精講班（直播授課，非錄播）微信群長期答疑 ?

還在認為沒有實驗就不能發表論文？還在為不精通挖掘 GEO，TCGA，SEER 的數據庫而痛苦不堪？還在為不知道如何找課題找靶點而苦惱？還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神？快來參加莫速乎的科研數據挖掘實戰專題學習班吧，挖掘別人的數據，發表自己的文章，一次學習，不再報班！

本會議由于帶著明確的目的性去學習 R 語言，且針對有/無 R 語言基礎的學員均具有很大寬容性，自開班起就廣受好評。隨著近年來生物信息學技術的普及，R 語言是每個科研工作者都有必要掌握的技能，以往漫無目的的學習 R 效果不理想，用 R 去進行科研數據挖掘，既學習了 R 又解決了實際科研問題。?

學完課程并掌握后能干什么：
1. 沒有課題的時候找到課題，沒有機制的時候挖掘機制
2. 為基金申請保駕護航，發表 paper 如虎添翼
3. 掌握 R 語言的核心技能，GEO，TCGA，SEER 的數據處理沒有壓力
4. 科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制。?

這是一份帶有誠意且注重實戰的數據挖掘課程。我們的目標是：一次學習，不再報班。

課程特點：
1. 不留秘密，私貨全出，全程只用 R 語言，關鍵步驟不隱藏。
2. 第一天晚上時間充分利用，增加帶有講師指導的練習，更多的訓練時間，更好的掌握。
3. 講最核心的知識，講通用的技能，適合各個專業。學后可應用到其他數據庫的挖掘。
4. 實例操作 (至少 3 個套路)，讓你快速掌握數據挖掘套路。
5. 現場完成一篇 paper 的思路以及圖表。
6. 講師陣容強大，內容豐富深入 ?

主講人簡介：果子老師，在生信方面具有豐富經驗，本次進行兩天一晚的高強度實操訓練，目標是讓大家一次學習不再報班。講師已在生信網站及公眾號發布上萬條生信相關帖子。作為臨床科研工作者，深知無課題之苦，因此愿將所學知識和盤托出，沒有隱藏。致力于給非生信專業人員普及生物信息學，擅長各種組學的處理，且講課詼諧幽默。

適合人群：廣大臨床/科研工作者及心有熱血被困囚籠的研究生 ?

課程安排：
第一天
08:30-11:55
R 語言基礎知識介紹
R 語言數據結構以及循環控制 (向量，因子，矩陣，數據框，列表,for 循環，if 控制)
編寫自己的第一個批量處理數據的程序
R 語言中數據框的操作 (增刪改查)
真實數據的清洗和整理
R 包以及 bioconductor 資源的使用
R 包無敵安裝攻略 R 語言繪圖系統
R 語言的讀入以及寫出數據
統一午餐
13:30-17:00
使用卡片復習 R 語言基礎知識（2 天中重復 4 次）
GEO 數據庫成套流程實戰（數據清洗，熱圖，火山圖，GO 分析，KEGG 分析，共表達分析）
GEO 數據便捷實用的 GSEA 分析
GEO 芯片的探針 probe 轉化方法匯總
多個 GEO 芯片聯合分析
TCGA 數據庫背景介紹+閱讀文獻
TCGA 相關的網頁工具匯總學習
介紹不同的癌癥和不同組學
不同的分析套路解讀 (WGCNA，signatures，miRNA-mRNA 配對或者 ceRNA 等)
TCGA 數據分析的軟硬件準備
下載及理解 TCGA 數據 (所有數據)
R 制作 TCGA 表型數據臨床三線表　
17:00-18:00
統一晚餐
晚上
18:00-21:00
R 語言數據框的操作練習 (掌握 tidyr 和 dplyr)
如何根據需求繪制一個漂亮的火山圖 (學習 ggplot2)
使用 R 語言制作特定腫瘤所有基因表達的數據庫
TCGA 原始數據的下載（GDC 的方法和 R 包方法）
任意癌癥任意基因在癌和癌旁的表達
如果有亞型，在不同亞型中的表達
如果有腫瘤有分期，在不同臨床分期中的表達
單個基因在多個正常組織中的表達
單個基因在多個細胞系中的表達
單個基因在多個腫瘤中的表達
兩個基因的相關性如何分析?

第二天
08:30-11:55
差異分析 (從 counts 數據開始整理表達數據，表達矩陣歸一化，DESeq2)
提取 mRNA 矩陣
提取 IncRNA 矩陣
提取 MiRNA 矩陣
ceRNA 網絡構建
單基因的 GSEA 分析
神技能：注釋任何一個基因包括長鏈非編碼 RNA
使用多種統計算法定位 signatures cox,lasso 回歸
生存分析
繪圖美化
任意癌癥中任意基因的生存分析
任意癌癥中批量生存分析
TCGA 文章的框架分析以及復現
答疑環節
統一午餐
13:00-16:30
利用 GEO 和 TCGA 數據庫找到課題
利用 GEO 和 TCGA 數據庫發掘下游機制
如何利用 GEO 和 TCGA 數據庫申請基金
如何利用 GEO 和 TCGA 數據庫發表文章
現場完成一篇生信文章的所有圖表
提出科研假設
根據科研假設下載整理數據導入 R 語言 ?????????????????????????????
在 R 語言中清洗和整理數據達到對應 R 包的要求
數據處理過程中調整分析策略
繪制各個部分需要的圖標 ?
時間地點：
第十九期 ??2020/7/11-12? ??（會議時間兩天 & 一晚）
第二十期 ??2020/8/15-16? ??（會議時間兩天 & 一晚）
報名付費成功后，課前發培訓需要應用到的軟件與安裝包，并且指導安裝 ???

注冊費用：3400 元/人 ?
兩天集中網絡授課，互動性好；
可開具會務，數據分析等發票；
可回放，可免費復聽；
參加培訓的學員可通過微信群繼續和老師交流，長期獲得答疑機會；
如果本次沒學會，以后還可免費參加本班（疫情過后可免費參加線下培訓）。?

主辦單位：上海莫速乎教育投資有限公司、上海荊麥信息科技中心?

報名咨詢：王老師 ?136 2183 4129（微信同號）?msh088@126.com

請來電或者微信聯系索取電子函件及報名回執表。 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

編輯： 會議君    來源：丁香園